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신테카바이오, NGS와 GPU제휴 적합한 프로그램 툴 개발
작성자 : 관리자작성일 : 12.10.29조회수 : 781
신테카바이오(대표 정종선)는 GPU에 기반한 게놈어셈블러 `Soap-GPU`와 단백질 시뮬레이터를 최적화 한 프로그램 툴을 개발, 곧 서비스를 실시할 예정이라고 3일 밝혔다.

이 프로그램은 차세대 시퀸싱 개발에 최적화 돼, 유전자 관련 개발에 큰 도움을 줄 수 있을 것으로 기대된다. 최근 차세대 게놈 시퀸싱 기술력(NGS, Next Generation Sequencing)은 점점 향상돼 하루 만에 결과 분석가능해졌다. 비용도 1000달러에 접근하면서 보급화가 촉진되고 있다. 이와 함께 차세대 고집적 병렬계산용 프로세서(GPU)인 테슬러 계열 `페르미`의 연산 능력 또한 크게 향상됐다. 한꺼번에 많은 정보 처리 능력을 필요로 하게 되면서 최근 과학계에서는 `Soap3-GPU`와 단백질 시뮬레이터(Amber-GPU) 기술이 결합된 모델이 새로운 이슈로 떠오르고 있다.

이 회사가 개발한 툴을 이용하면 양 쪽 프로그램을 최적화 할 수 있어 속도는 최대 100배 향상 시킬 수 있다. 또한 설치가 어려운 `Amber-GPU` 시스템의 설치뿐만 아니라 버추얼 스크리닝, 도킹 및 컴플렉스 모델링까지 다양한 응용이 가능하다고 회사측은 설명했다.

링크 : http://www.dt.co.kr/contents.html?article_no=2012070302019932758004
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